La CUP es una persona jurídica sin fines de lucro. Está organizada sobre la Asamblea General de Socios, que es la instancia máxima de la institución a la cual concurre la totalidad de los miembros activos de la misma y en la que se da cuenta de la marcha de la institución
Los socios activos de la CUP son:
- Universidad de las Américas
- Universidad Bernardo O’Higgins
- Universidad Santo Tomás
- Universidad Autónoma de Chile
- Universidad Adventista de Chile
- Universidad Miguel de Cervantes
- Universidad de Viña del Mar
- UNIACC
- Universidad Central
- Universidad Academia de Humanismo Cristiano
- Universidad Finis Terrae
- Universidad SEK
- Universidad Católica Silva Henríquez
- Universidad Gabriela Mistral
- Universidad San Sebastián
- Universidad del Alba
